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Monocle3を用いた解析

Monocle3を用いた解析

目次

1. はじめに

本記事は、以下の続きです。

https://www.bioinforest.com/vcell-scanpy

本記事ではRのライブラリであるMonocle3による1細胞RNA-Seqデータの解析について説明します。

2. 目次

  • 前処理

  • バッチ正規化

  • クラスタリングによる細胞集団の定義

  • 可視化

  • Pseudotime解析

  • Loupeブラウザへの出力