
Monocle3を用いた解析
目次
1. はじめに
本記事は、以下の続きです。
https://www.bioinforest.com/vcell-scanpy
本記事ではRのライブラリであるMonocle3による1細胞RNA-Seqデータの解析について説明します。
2. 目次
-
前処理
-
バッチ正規化
-
クラスタリングによる細胞集団の定義
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可視化
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Pseudotime解析
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Loupeブラウザへの出力



本記事は、以下の続きです。
https://www.bioinforest.com/vcell-scanpy
本記事ではRのライブラリであるMonocle3による1細胞RNA-Seqデータの解析について説明します。
前処理
バッチ正規化
クラスタリングによる細胞集団の定義
可視化
Pseudotime解析
Loupeブラウザへの出力