STREAMを用いた解析
目次
1. はじめに
本記事は、以下の続きです。
https://www.bioinforest.com/vcell-signac
本記事ではPythonのライブラリであるSTREAMによる1細胞RNA-Seq/ATAC-Seqデータの解析について説明します。
2. 目次
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STREAMプロットの作成。
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Pseudotimeに沿って有意に変動する遺伝子の抽出。
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Pseudotimeに沿って変化する遺伝子の発現量のカスタムPlot.
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Pseudotimeに沿って変化する遺伝子のクロマチン領域のカスタムPlot.