Seuratを用いた解析
目次
1. はじめに
本記事は、以下の続きです。
https://www.bioinforest.com/vcell-monocle3
本記事ではRのライブラリであるSeuratによる1細胞RNA-Seq/ATAC-Seqデータの解析について説明します。
2. 目次
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次元削減・クラスタリングによる細胞集団の可視化
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マーカー遺伝子の自動抽出とテーブル描画
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Bokehを用いたカスタムFigureの作成
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scATAC-Seqに基づいた次元削減・クラスタリングによる細胞集団の可視化
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WNNを用いた次元削減・クラスタリングによる細胞集団の可視化
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Ridge Plotなどのその他の可視化機能。