Forest background
バイオインフォの森へようこそ
scanpyを用いた解析

scanpyを用いた解析

目次

1. はじめに

本記事は、以下の続きです。

https://www.bioinforest.com/vcell-description

本記事ではPythonのライブラリであるscanpyによる1細胞RNA-Seqデータの解析について説明します。

2. 目次

  • 実験原理とデータ構造の説明。

  • Cell Rangerによる前処理。

  • scanpyによる前処理。

  • Cell Rangerによる複数データの統合。

  • Monocleによる複数データの統合。